Pavojingiausios ligos jūros kiaulytėms yra viduriavimas, vitamino C trūkumas, plaučių uždegimas. Nuo šių ligų jas dažniausiai ištinka mirtis. Daug lengviau išgyja nuo odos ligų, tačiau kai kurios yra pavojingos ir žmogaus sveikatai.

Ligos

1.Odos ligos

• Nuplikimai atsiranda galvos, kaklo srityje. Šia liga serga nėščios pateles. Kailis vėl atauga atsivedus jauniklius.
• Kerpligės metu odoje atsiranda žaizdos ir pūsles, lūžinėja plaukai. Gydyti reikia Griseofulvin 0,8 mg/kg su pašaru suaugusiam, 4-6 sav. Norint išvengti šios ligos reikia, jog narvelis būtų nuolat valomas. (pavojinga žmogaus sveikatai)
• Uteles, niežai. Gydoma specialiais šampūnais, bet geriausia nedidelėmis injekcijomis, kurias suleis veterinaras. Leidžiama 3-6 kartus priklausomai nuo gijimo eigos. (kai kurios pavojingos žmogaus sveikatai)

2.Padodermanitas(žaizdoti kulnai). Žaizdos atsiranda galūnėse.

3.Užpakalinių kojų raumens uždegimas. Jūros kiaulytes turi polinki sirgti užpakaliniu kojų raumenų uždegimu. Pirmasis šio susirgimo požymis - velkama viena arba abi užpakalinės kojos. Tai labai panašu į paralyžiaus padarinius, tačiau galima lengvai nustatyti, koks tai susirgimas. Reikia patikrinti skausmo refleksą. Jei jūros kiaulytė, pajutusi skausmą, judina koja, vadinasi, ji susirgo būtent raumenų uždegimu. Gydymas bus ilgas, bet nesunkus: reikės tik masažuoti ir šildyti sergančias galūnes.

4.Paralyžius. Tai nepagydoma liga. Paralyžiuota jūros kiaulyte nuo ligos pradžios išgyvena tik 8-14 dienų.

5.Gydymas švirkščiant Neomycin 30mg/kg, Chephalorine, Cephalexin 15 mg/kg švirkšti į raumenis 2 kartus per diena.

6.Cervikalinio limfadenito metu padidėja limfiniai kaklo mazgai. Gydoma Cephalorite 14 dienų.

7.Kvepavimo ligos dažniausiai atsiranda, kai būna bloga priežiūra, trūksta vitamino C. Prasideda čiaudulys, iš nosies teka išskyros, gyvūnėlis atsisako maisto, tampa nejudrus, tupi viename kampe, mažėja svoris ir apetitas. Greitu laiku gyvūnėli ištinka  mirtis.

8.Virskinimo sistemos sutrikimas. 

• Netaisyklingas sukandimas. Gyvūnėliui dantys išauga neįprastoje vietoje. Jis gali nenoriai ėsti, nes jaučia skausmus, jam atsiveria žaizdos. Gydymu turi užsiimti chirurgas.
• Viduriavimai. Viena iš labiausiai paplitusiu ligų yra vidurių užkietėjimas. Šios ligos priežastis –blogas maitinimas, ypač kai racione yra daugiau sauso pašaro nei daržovių arba kai retai gauna augalų kaupiančių daug vandens. Vidurių užkietėjimas - greit pagydomas susirgimas. Reikės tik pakeisti jūros kiaulytės racioną.
• Išmatose randama sukėlėju ocistų .Gydoma 2% Sulphamethazine su 7-10 dienų pertrauka.
• Salmonelių (bakterijų) sukelti viduriavimai. Susirgusi šia liga besilaukianti jūros kiaulyte praranda savo jauniklius (persileidžia). Staigiai krinta svoris, sumažėja judrumas ir ištinka staigi mirtis.
• Pseudituberkuliozinis viduriavimas. Gyvūnėlis miršta per 3-4 savaites, jei liga ūmi per 1-2 paras. Ligos metu jūros kiaulytė tampa ypač silpna.
• Nuo gydymo antibijotikais sukeltas viduriavimas. Sutrinka normali žarnyno mikroflora. Cefazolin 50 mg/kg švirkšti į raumenis 2 kartus per diena. Net 25% sukelia mirtį.
• Nespecifiniu viduriavimu gali susirgti neseniai į naujus namus pakeitusi jūros kiaulytė. Dažniausiai ligos priežastys būna stresas ir staigus maisto pakeitimas.
• Užpakalinių kojų raumens uždegimas. Jūros kiaulytes turi polinki sirgti užpakaliniu kojų raumenų uždegimu. Pirmasis šio susirgimo požymis - velkama viena arba abi užpakalinės kojos. Tai labai panašu į paralyžiaus padarinius, tačiau galima lengvai nustatyti, koks tai susirgimas. Reikia patikrinti skausmo refleksą. Jei jūros kiaulytė, pajutusi skausmą, judina koja, vadinasi, ji susirgo būtent raumenų uždegimu. Gydymas bus ilgas, bet nesunkus: reikės tik masažuoti ir šildyti sergančias galūnes.
• Paralyžius. Tai nepagydoma liga. Paralyžiuota jūros kiaulyte nuo ligos pradžios išgyvena tik 8-14 dienų.
• Kaprostazė. Dar viena vidurių sutrikimo liga - koprostazė. Tiesiojoje žarnoje kaupiasi sausos, dažnai raudonos spalvos išmatos. Išeinamoji anga visą laiką išsiplėtusi ir žvėreliui pajudėjus iš jos sklinda nemalonus kvapas. Gydyti teks ilgai. Vaistai - du kartus per diena 10 lašu aliejaus, B grupės vitaminai ir antibakteriniai preparatai. Taip pat būtina kiekvieną dieną kalio permanganato skiediniu reikės apiplauti jūros kiaulytės išanginę.

9.Vitamino C trukumas. Ligos metu jūros kiaulyte sunkiai juda, jai skauda sąnarius, staigiai krinta svoris. Gydyti girdant vitaminą C 100mg.  per diena. Gydymas vyksta tol kol išnyksta ligos požymiai.

10. Pogimdyvinė toksemija. Susergama 1-2 savaites prieš gimdymą, paskutinėmis nėštumo savaitėmis ir 4 dienas po gimdymo. Ligos metu patelė būna depresinės būsenos, neturi apetito arba iš vis nevalgo, trūkčioja kvėpavimas. Nepastebėjus laiku šių požymių, jūros kiaulytė miršta. Pastebėjus bent porą ligos požymių  reikia imtis staigaus gydymo. Gydymas: į raumenis švirkšti kortikosteroidus, į paodį dekstorozės, svarbiausia- vengti stresų.

11.Mastitai. Gydymas. Antibijotikai.Jais gydyti 7-10 dienu, o vietiskai naudojama Dermisol ir kt.